计算化学踩坑合集¶
有时候，我们会沿用别人测试过的设置进行计算，而不一定会从头进行系统测试。但是，作为计算软件的使用者，我们需要意识到某些可能会出错的地方（或许是很棘手的问题），而不是将这些问题视而不见(sweep the problems under the carpet)。在此文章记录大家在项目中碰到的奇奇怪怪的坑，以供参考。
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Cu pseudopotential¶
涉及 Cu 二价离子的计算可能要采用 19 电子的赝势 (semi-core potential)。
We found that only the computation of the orbital energy of the empty d-level of aqueous Cu2+ requires the use of a semi-core potential with explicit 3s and 3p electrons. Ref: J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 12, 3928–3938 [link]