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Anaconda 使用指南

初始化设定

登录 HPC

module load miniconda/3
conda init bash
这会自动修饰你的 ~/.bashrc 文件。

登出HPC,再次登陆

打开你的~/.condarc文件

vim ~/.condarc

修改以下文件并放入你的~/.condarc里

channels:
  - defaults
ssl_verify: true
envs_dirs:
#modify, this is where your environment file in
  - /data/ch2_101/conda/env
pkgs_dirs:
#modify, this is where your package file in
  - /data/ch2_101/conda/pkgs

退出文件

通过以下命令确认你的环境

conda env list

创建你自己的环境

创建你自己的环境,之后都启用自己的环境进行使用

conda create -n <your env name> python

conda activate <your env name>

修饰你的终端前缀

用上述方法创造的环境会在你的终端命令行前加上一长串路径,例:

(/Users/USER_NAME/research/data-science/PROJECT_NAME/envs) $

可以用以下命令缩短前缀

conda config --set env_prompt '({name})'

此命令会修改你的.condarc文件

参考文献

在集群上使用 Jupyter Notebook

请参见 OpenSCOW/Open Ondemand使用说明

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