软件默认版本推荐¶
目前集群上很多软件都编译了多个版本,但由于软硬件平台、版本、环境的更新,需要对常用软件的一些版本梳理如下,并给出建议使用版本。
Zeus 集群采用 module
对软件环境进行管理,通常使用前需要加载环境,例如 module load vasp/5.4.4
即可加载 VASP 5.4.4 版本运行所需环境。因此下文对软件推荐版本的说明,将会列出Zeus上使用的<module name>
,具体使用时请自行补全为module load <module name>
。
注意如果在 ~/.bashrc
或 ~/.bash_profile
中加载了环境,如果与下述版本用到的环境存在冲突,可在提交脚本中加入module purge
行进行卸载,以免产生冲突。
注意: CentOS 7 默认使用的 GCC 版本为4.9.4,Python 版本为2.7,Python 3 版本为 3.6,故以下涉及到上述环境若未加载,则表示使用默认环境。
软件名 | 推荐版本 | 命令 | 需要调用环境 | 备注 |
---|---|---|---|---|
VASP | vasp/5.4.4 |
常规计算:vasp_std Gamma点 : vasp_gam |
intel/17.5.239 mpi/intel/2017.5.239 |
CPU并行计算 |
CP2K | cp2k/7.1 |
启用OpenMP:cp2k_psmp 未启用: cp2k_popt |
gcc/5.5.0 intel/17.5.239 mpi/intel/2017.5.239 |
CPU并行计算 |
DeePMD-kit | deepmd/2.0-cuda11.3 |
训练:dp 跑MD: lmp_mpi |
cuda/11.3 gcc/7.4.0 intel/17.5.239 mpi/intel/2017.5.239 |
GPU加速势函数训练,采用的Lammps版本是20201029 |